Wand- und Deckenmalerei

In der Ostkrypta haben sich seitlich der mittleren Apsis zwei romanische Bischofsporträts erhalten, die Bischof Lüthold von Aarburg, den Bauherrn des spätromanischen Münsters, und Bischof Adalbero II., den Bauherrn des frühromanischen Münsters, abbilden dürften. Die Wandmalereien sind von höchster künstlerischer Qualität und wurden anlässlich der Weihe des Marienaltars (1202) neben diesem angebracht. Ein gotischer Malereizyklus (um 1400) ist an den Deckengewölben der drei Apsisjoche erhalten: Er zeigt von links nach rechts Szenen aus dem Leben der Heiligen Margaretha, Martin, Maria und Anna mit Joachim. Zum Marienleben ist die Geburt Christi, die Anbetung der Könige, die Flucht nach Ägypten und die Krönung Mariens durch Christus dargestellt.